Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TnxbO35452 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnxbO35452 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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TnxbO35452 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TnxbO35452 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TnxbO35452 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnxbO35452 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnxbO35452 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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TnxbO35452 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TnxbO35452 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TnxbO35452 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms