Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrcpO35427 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrcpO35427 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrcpO35427 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrcpO35427 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrcpO35427 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrcpO35427 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrcpO35427 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms