Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xbp1O35426 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xbp1O35426 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms