Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppef2O35385 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppef2O35385 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppef2O35385 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms