Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Abcc1O35379 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Abcc1O35379 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc1O35379 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms