Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad6O35182 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad6O35182 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad6O35182 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smad6O35182 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms