Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata2O09100 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms