Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltbp2O08999 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltbp2O08999 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltbp2O08999 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp2O08999 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms