Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp12O08736 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp12O08736 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp12O08736 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp12O08736 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp12O08736 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp12O08736 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms