Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tcrg-C3L7N479 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tcrg-C3L7N479 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tcrg-C3L7N479 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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