Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2al1oL7MU04 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1oL7MU04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1oL7MU04 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms