Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Gm19965J3QNY8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Gm19965J3QNY8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Gm19965J3QNY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Gm19965J3QNY8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Gm19965J3QNY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Gm19965J3QNY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Gm19965J3QNY8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Gm19965J3QNY8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Gm19965J3QNY8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Gm19965J3QNY8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm19965J3QNY8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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