Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21798J3QNU5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21798J3QNU5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms