Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20918J3QN17 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.6 ms