Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20834J3QM72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20834J3QM72 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms