Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21969J3QJZ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21969J3QJZ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21969J3QJZ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms