Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm20830J3KML6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20830J3KML6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20830J3KML6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm20830J3KML6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20830J3KML6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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