Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AK157302I3ITR1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AK157302I3ITR1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms