Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm29394H3BIW7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm29394H3BIW7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms