Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tubgcp6G5E8P0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tubgcp6G5E8P0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms