Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r12G5E8G1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms