Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nccrp1G3X9C2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nccrp1G3X9C2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms