Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm16519F8VQK7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm16519F8VQK7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm16519F8VQK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms