Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ScaperF8VQ70 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms