Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
5830473C10RikF8VQ07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
5830473C10RikF8VQ07 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
5830473C10RikF8VQ07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
5830473C10RikF8VQ07 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
5830473C10RikF8VQ07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms