Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Farp1F8VPU2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Farp1F8VPU2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms