Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110082J24RikF6Z6Z2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
3110082J24RikF6Z6Z2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms