Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Crocc2F6XLV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Crocc2F6XLV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Crocc2F6XLV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms