Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r40F6W043 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r40F6W043 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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