Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm340F6RGI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms