Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Rnf165E9QAU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Rnf165E9QAU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf165E9QAU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Rnf165E9QAU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Rnf165E9QAU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Rnf165E9QAU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Rnf165E9QAU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms