Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phldb3E9QAF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Phldb3E9QAF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms