Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod3E9QA62 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms