Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cald1E9QA15 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms