Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U2

Speer2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer2E9Q9U2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer2E9Q9U2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer2E9Q9U2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms