Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r152E9Q9N3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r152E9Q9N3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms