Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8882E9Q7E4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8882E9Q7E4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms