Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85cE9Q6B2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms