Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtproE9Q612 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtproE9Q612 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms