Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FancfE9Q5Z5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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FancfE9Q5Z5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FancfE9Q5Z5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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