Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ythdc1E9Q5K9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc1E9Q5K9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms