Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms