Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcc4E9Q236 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcc4E9Q236 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms