Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc171E9Q1U1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms