Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdr1E9Q0B4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms