Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd2E9PZM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd2E9PZM4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms