Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkhd1E9PZ36 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkhd1E9PZ36 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkhd1E9PZ36 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkhd1E9PZ36 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkhd1E9PZ36 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkhd1E9PZ36 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pkhd1E9PZ36 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkhd1E9PZ36 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms