Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp4E9PYK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp4E9PYK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Parp4E9PYK3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms