Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms