Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms